一、防控策略
针对斑潜蝇的防控工作，必须贯彻落实“预防为主，综合防治”的植保方针。根据其发生危害特点，坚持以生态调控的农业防治为基础，充分利用非化学防治方法、辅以化学防治。防治以综合防治为指导思想，加强虫情监测，立足早防治，以控制虫源基数和切断传播途径为关键措施。
二、综合防控技术
1 加强检疫措施，控制扩散传播
针对检疫性斑潜蝇，尽可能不从发生该斑潜蝇的地区调运相关的寄主作物或花卉苗木。同时，采取检疫措施，对调入、调出的蔬菜、花卉植物及其包装材料进行严格检疫，可有效控制斑潜蝇的传播与扩散。如在调运的寄主作物或花卉苗木发现斑潜蝇幼虫和蛹，可采用冷冻、熏蒸、辐射等方法进行处理。
2 加强田园管理，减少虫源基数
2.1 加强田园清洁，压低种群数量
适当摘除部分含潜道较多及枯黄老叶携出棚外深埋或烧毁；此外，在农作物收获后，温室或田间留下的作物残枝败叶都会有斑潜蝇的卵、幼虫或蛹存在。作物的残枝败叶不能随意丢弃或堆积，而应及时将其清理出温室或大田，集中烧毁或掩埋，从而切断斑潜蝇在不同生长季节、不同作物之间的传播，以压低斑潜蝇的种群数量，减少传播危害。
2.3 适时收获，及时灭茬除虫
由于7、8月份温度明显上升，斑潜蝇增殖速度加快，因此要动员农户适时收获，灭茬处理，减少虫源数量。处理方法：（1）大棚内可采用高温闷棚，即在大棚蔬菜收获后，将大棚密闭，利用高温将棚内残留的斑潜蝇杀死，减少其作为露地作物的危害虫源；（2）在菜园内，可采取覆盖塑料薄膜，深翻土，再覆盖塑料薄膜等方式，使其地温超过60℃以上，从而达到高温杀虫以及深埋斑潜蝇蛹的作用。高温闷棚和薄膜覆盖还可以起到对许多蔬菜病害，特别是土传病害起到高温消毒的作用；（3）有条件的蔬菜基地，可在蔬菜收获后防水淹没菜地2-3天，能有效杀灭在土中的斑潜蝇蛹。
2.4 冬季低温揭膜耕翻，压低越冬虫源
在斑潜蝇发生危害严重的温室大棚，利用寒冷冬天把温室短期敞开或者耕翻土壤将越冬蛹或者成虫暴露低温，可有效控制斑潜蝇的越冬基数，有效控制该虫来年危害。
3 切断传播途径，控制增殖扩散
3.1 健全育苗措施，培育无虫苗
把好育苗关，培育无虫苗，切断通过幼苗传入蔬菜、花卉生产大棚的途径。冬季和春季的育苗房要与生产温室分开，育苗前清除周边的杂草和残株，培育无虫苗定植到无虫保护地内。由于苗床面积小、苗龄低、用药（工）省、防效好，及时扑杀成虫可减少虫口密度，便于无虫苗的培育。也可在苗床上覆盖防虫网，防止斑潜蝇进入。
3.2 轮作换茬，切断其生活史
在斑潜蝇重发生的大棚或日光温室，可改种斑潜蝇不喜好的寄主，如韭菜或大蒜、姜、苦瓜等，从寄主上切断其生活史。
4 作物合理布局、减轻危害
利用斑潜蝇对作物的选择特性，在生产中尽量避免连片种植斑潜蝇嗜好、但作物生长期和收获期不同的作物，以减少斑潜蝇在不同作物上获得连续生存和危害的条件；此外，在生产中将斑潜蝇嗜好与非嗜好的作物进行间作，也可以间接降低其危害，由于一些农作物的不同品种对斑潜蝇也具有一定的抗（耐）性，因此可选择具有抗（耐）虫性的作物品种种植，以降低斑潜蝇的危害程度。
5 物理机械防治
5.1 黄板诱杀成虫
利用斑潜蝇的趋黄性，在田间、温室或大棚中插置黄板进行诱杀，可适度降低虫口基数。具体方法是在斑潜蝇成虫高峰期，从市场购买标准规格的黄板或自制黄板，插在作物地里或大棚内，225~300 个/hm2，可有效诱杀成虫，减少田间虫口密度。
5.2 防虫网的利用
在蔬菜和花卉生产大棚的修建时，顶部常用塑料防雨膜，周边使用防虫网。由于三叶斑潜蝇体积较小，建议选择20~25目之间的防虫网，可对斑潜蝇及一些小型害虫起到阻隔作用，以减少它们的危害。防虫网覆盖前应清理田间杂草、清除枯枝残叶，在播种或移栽前用药剂进行土壤处理，尽可能减少地下害虫的发生。整个生长期要将防虫网四周压实封严，以防害虫潜入为害。
6 生物防治
6.1 保护和释放天敌
合理利用斑潜蝇寄生蜂和捕食性天敌，同时在化学防治时，应尽量采用高效、低毒、安全的农药，减少对天敌的危害。
6.2 使用生物农药
阿维菌素、灭蝇胺等生物药剂对三叶斑潜蝇也有较好的防效。
7 化学防治技术
7.1 施药的原则
（1）斑潜蝇繁殖力高，田间世代和虫态重叠复杂，加之很难找到一种药能同时防治各种虫态，因此在斑潜蝇大发生时，要采取每隔3~5天喷药一次，连续用药2~3次。
（2）由于斑潜蝇的卵产在寄主叶肉组织中同时幼虫直接在寄主植物叶片内潜食危害，对农药具有一定的耐受能力。因此可以选择一些具有内吸作用的药剂或复配剂。
（3）在斑潜蝇可作短距离的飞翔或随风迁移扩散，因此大发生时，有条件的地区要尽可能实行“统防统治”，即实行“三统一”：统一时间、统一药剂、统一施药方法，连续用药2~3次，可迅速压低虫口密度，遏制其迅速扩散的势头。此外，对发生严重地块附近的田边、沟边、路边杂草作为重点清除对象，也可对这些杂草喷施灭生性除草剂，如“百草枯”。
7.2 药剂防治关键时期
（1）冬季在日光温室或保暖大棚盖棚时进行一次药剂防治；来年春季（4~5月）要进行1~2次药剂防治；在7月底-8月初发生危害的高峰期，用药1-2次。
（2）防治成虫一般在早晨晨露未干前，幼虫一般在上午露干后至11 时前施药效果最佳。由于斑潜蝇虫体较小，它可以随风向附近扩散，因此在露地不能越冬的地区，斑潜蝇的发生往往会形成明显的核心区和扩散区。因此露地防治的关键时期要选在作物虫口密度较低时或形成发生核心区时用药。
7.3 施药方法
（1）温室大棚熏蒸：成虫发生高峰期可采用烟雾剂熏蒸压低虫口密度，即温室大棚每平方米应用80%敌敌畏0.35ml和2.5%敌杀死0.05ml与消抗液0.025ml混合，在密闭棚室的地面上，用两块砖支撑一块凹形铁皮，下面放上蜡烛点燃，倒入定量配制的药液，每667平方米设4~5个点，使药液蒸发熏蒸棚室；也可用商品化的“灭蝇灵” 烟熏剂或105异丙威烟剂每亩用烟熏剂棚内200 g，露地300g，连续熏杀2~3次。
（2）喷雾：用背负式机动喷雾器的烟雾发生器，把农药油剂雾化成直径0.5mm以下的雾滴，可长时间在无气流大棚及田间起到较好的防治作用。
7.4 推荐药剂
    通过药剂试验筛选出的一些效果较好的药剂，如高效氯氰菊酯、杀虫双、毒死蜱、阿维•苏云菌、灭蝇胺、斑潜净等药剂。在实际应用上述药剂时，通常还可以将作用机理不同且没有拮抗的药剂混合施用。